Um das Queere Zentrum Göttingen kümmern sich das hauptamtliche Zentrumsteam und das ehrenamtliche Vorstandsteam.
Aktuell sind im Queeren Zentrum sechs Personen angestellt – in der Zentrums- und Ehrenamtskoordination, im Jugendprojekt equity* sowie in der Buchhaltung und in der Koordination der Trans*Beratung.